Um es mal technisch zu erklären:
JEDES Paket was auf der DS installiert wird, ist unter /var/packages/Paketname zu finden, dort gibt es wiederum den Ordner "scripts" in welchem abgesehen von Install-Skripten auch das "start-stop-status" Skript ist. Dieses Skript, wenn man das Paket so konfiguriert, wird bei jedem Start der DS mit dem "start" Parameter aufgerufen, also das gleiche wie wenn man das Skript per Hand mit "start-stop-status start" aufgerufen wird. Da es bei mir und den meisten hier einwandfrei funktioniert, kann ich nur drauf tippen das auch bei dir ein Problem vorliegt, welches du nur entdecken wirst wenn du das mal manuell startest und schaust was JDownloader macht. Das Paketzentrum spiegelt übrigens auch nicht den Status des Paket's in Echtzeit wieder, sondern aktualisiert sich nur alle 30 Sekunden oder so. Sprich, auf der Shell ist der Prozess da, das "start-stop-status" Skript mit dem Parameter "status" wird auch anzeigen das der Prozess läuft, aber das Paketzentrum ist etwas hinterher. Das Paketzentrum benutzt nicht mal das "status" Parameter sondern prüft einfach nur ob unter "/var/packages/Paketname" eine Datei namens "enabled" existiert.