Da musst du halt Platz schaffen ...
Wenn Speicherplatz „verschwunden“ ist, dann könnte es daran liegen, dass du irgendetwas mit Versionierung laufen hast. Das kann Syno-eigen sein (wie z.B. Drive oder HyperBackUp), aber auch externe Jobs mit der Syno als Ziel, wie z.B. Time Machine oder andere versionierende Backup-Software.
Durch die Versionierung werden Dateien mehrfach abgelegt, damit man Änderungen rückgängig machen kann. Das frisst natürlich Speicherplatz.
Wenn du weißt, was es ist, dreh die Versionierung runter (weniger Versionen) oder schalte sie ab, wenn du sie nicht benötigst.
